Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP6V1E1P36543 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms