Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL3P36405 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL3P36405 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARL3P36405 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL3P36405 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL3P36405 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL3P36405 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL3P36405 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL3P36405 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL3P36405 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARL3P36405 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARL3P36405 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARL3P36405 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL3P36405 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL3P36405 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL3P36405 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL3P36405 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL3P36405 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL3P36405 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL3P36405 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL3P36405 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL3P36405 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL3P36405 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL3P36405 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL3P36405 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL3P36405 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL3P36405 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL3P36405 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL3P36405 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL3P36405 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL3P36405 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL3P36405 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL3P36405 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms