Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD12P35452 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms