Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR7P32248 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR7P32248 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR7P32248 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR7P32248 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR7P32248 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR7P32248 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR7P32248 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR7P32248 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR7P32248 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR7P32248 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR7P32248 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR7P32248 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR7P32248 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR7P32248 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR7P32248 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR7P32248 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR7P32248 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR7P32248 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR7P32248 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR7P32248 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR7P32248 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR7P32248 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR7P32248 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCR7P32248 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCR7P32248 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR7P32248 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR7P32248 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR7P32248 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR7P32248 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR7P32248 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR7P32248 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR7P32248 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR7P32248 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR7P32248 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR7P32248 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR7P32248 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR7P32248 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR7P32248 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR7P32248 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR7P32248 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR7P32248 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR7P32248 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR7P32248 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR7P32248 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR7P32248 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR7P32248 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR7P32248 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR7P32248 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR7P32248 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR7P32248 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR7P32248 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR7P32248 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR7P32248 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR7P32248 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR7P32248 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCR7P32248 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR7P32248 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR7P32248 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR7P32248 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR7P32248 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR7P32248 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR7P32248 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms