Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR1BP31321 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAR1BP31321 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms