Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC5P28715 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms