Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1C1P21283 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1C1P21283 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1C1P21283 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms