Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCF2P19878 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCF2P19878 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCF2P19878 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCF2P19878 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCF2P19878 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCF2P19878 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCF2P19878 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF2P19878 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF2P19878 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF2P19878 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF2P19878 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF2P19878 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF2P19878 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCF2P19878 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCF2P19878 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCF2P19878 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF2P19878 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF2P19878 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCF2P19878 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF2P19878 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF2P19878 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF2P19878 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF2P19878 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCF2P19878 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF2P19878 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF2P19878 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF2P19878 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF2P19878 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF2P19878 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF2P19878 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF2P19878 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF2P19878 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF2P19878 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCF2P19878 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF2P19878 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF2P19878 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF2P19878 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCF2P19878 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF2P19878 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF2P19878 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF2P19878 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF2P19878 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF2P19878 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF2P19878 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF2P19878 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCF2P19878 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCF2P19878 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF2P19878 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF2P19878 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF2P19878 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF2P19878 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF2P19878 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF2P19878 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF2P19878 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCF2P19878 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCF2P19878 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms