Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRAP19793 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRAP19793 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRAP19793 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RXRAP19793 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RXRAP19793 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRAP19793 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRAP19793 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RXRAP19793 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RXRAP19793 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RXRAP19793 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRAP19793 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRAP19793 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRAP19793 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRAP19793 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRAP19793 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRAP19793 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRAP19793 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRAP19793 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRAP19793 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRAP19793 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRAP19793 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRAP19793 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRAP19793 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRAP19793 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRAP19793 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRAP19793 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRAP19793 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRAP19793 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRAP19793 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRAP19793 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRAP19793 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRAP19793 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRAP19793 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRAP19793 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRAP19793 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRAP19793 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRAP19793 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRAP19793 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRAP19793 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRAP19793 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRAP19793 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRAP19793 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRAP19793 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRAP19793 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRAP19793 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RXRAP19793 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RXRAP19793 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RXRAP19793 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RXRAP19793 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RXRAP19793 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RXRAP19793 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RXRAP19793 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RXRAP19793 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RXRAP19793 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RXRAP19793 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RXRAP19793 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RXRAP19793 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RXRAP19793 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RXRAP19793 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RXRAP19793 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXRAP19793 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RXRAP19793 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RXRAP19793 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RXRAP19793 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RXRAP19793 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RXRAP19793 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RXRAP19793 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RXRAP19793 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RXRAP19793 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RXRAP19793 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RXRAP19793 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXRAP19793 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXRAP19793 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXRAP19793 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXRAP19793 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXRAP19793 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXRAP19793 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXRAP19793 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRAP19793 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRAP19793 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRAP19793 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRAP19793 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRAP19793 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRAP19793 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXRAP19793 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms