Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME1P15531 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME1P15531 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME1P15531 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME1P15531 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME1P15531 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME1P15531 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME1P15531 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME1P15531 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME1P15531 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME1P15531 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME1P15531 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME1P15531 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME1P15531 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME1P15531 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME1P15531 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME1P15531 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME1P15531 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME1P15531 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME1P15531 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME1P15531 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME1P15531 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME1P15531 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME1P15531 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NME1P15531 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME1P15531 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME1P15531 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME1P15531 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME1P15531 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NME1P15531 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME1P15531 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME1P15531 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME1P15531 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME1P15531 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME1P15531 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME1P15531 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME1P15531 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME1P15531 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME1P15531 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NME1P15531 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME1P15531 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME1P15531 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME1P15531 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME1P15531 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME1P15531 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME1P15531 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms