Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-EP13747 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-EP13747 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms