Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFD1P11586 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTHFD1P11586 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms