Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN8OSP0DMR3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms