Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPAP09012 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPAP09012 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms