Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS17P08708 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS17P08708 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS17P08708 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS17P08708 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS17P08708 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS17P08708 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS17P08708 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS17P08708 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS17P08708 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS17P08708 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS17P08708 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS17P08708 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS17P08708 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS17P08708 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS17P08708 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS17P08708 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS17P08708 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS17P08708 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS17P08708 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS17P08708 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS17P08708 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS17P08708 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS17P08708 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS17P08708 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS17P08708 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS17P08708 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS17P08708 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS17P08708 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS17P08708 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS17P08708 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS17P08708 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS17P08708 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS17P08708 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS17P08708 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS17P08708 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS17P08708 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS17P08708 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS17P08708 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS17P08708 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS17P08708 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS17P08708 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS17P08708 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS17P08708 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS17P08708 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS17P08708 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS17P08708 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS17P08708 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS17P08708 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS17P08708 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS17P08708 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS17P08708 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms