Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB1P08034 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB1P08034 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB1P08034 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB1P08034 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB1P08034 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB1P08034 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB1P08034 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB1P08034 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB1P08034 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB1P08034 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB1P08034 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB1P08034 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB1P08034 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB1P08034 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB1P08034 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB1P08034 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB1P08034 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB1P08034 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB1P08034 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB1P08034 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB1P08034 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB1P08034 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB1P08034 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB1P08034 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB1P08034 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB1P08034 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB1P08034 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB1P08034 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB1P08034 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB1P08034 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB1P08034 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB1P08034 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB1P08034 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB1P08034 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB1P08034 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB1P08034 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB1P08034 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB1P08034 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB1P08034 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB1P08034 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB1P08034 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB1P08034 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB1P08034 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB1P08034 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB1P08034 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB1P08034 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB1P08034 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB1P08034 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB1P08034 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB1P08034 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB1P08034 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB1P08034 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB1P08034 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB1P08034 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB1P08034 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB1P08034 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB1P08034 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB1P08034 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB1P08034 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB1P08034 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB1P08034 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB1P08034 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB1P08034 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB1P08034 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB1P08034 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB1P08034 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB1P08034 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB1P08034 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB1P08034 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB1P08034 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB1P08034 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB1P08034 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB1P08034 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB1P08034 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB1P08034 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB1P08034 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB1P08034 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB1P08034 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB1P08034 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB1P08034 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB1P08034 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms