Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB3P05106 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGB3P05106 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms