Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP1A1P05023 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A1P05023 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms