Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPN1P04843 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPN1P04843 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPN1P04843 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPN1P04843 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPN1P04843 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPN1P04843 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPN1P04843 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPN1P04843 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPN1P04843 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPN1P04843 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPN1P04843 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPN1P04843 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPN1P04843 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPN1P04843 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPN1P04843 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPN1P04843 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPN1P04843 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPN1P04843 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPN1P04843 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPN1P04843 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPN1P04843 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPN1P04843 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPN1P04843 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPN1P04843 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPN1P04843 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPN1P04843 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPN1P04843 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPN1P04843 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPN1P04843 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPN1P04843 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPN1P04843 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPN1P04843 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPN1P04843 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPN1P04843 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPN1P04843 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPN1P04843 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPN1P04843 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPN1P04843 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPN1P04843 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RPN1P04843 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPN1P04843 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPN1P04843 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPN1P04843 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPN1P04843 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPN1P04843 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPN1P04843 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPN1P04843 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPN1P04843 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPN1P04843 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPN1P04843 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPN1P04843 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPN1P04843 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPN1P04843 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPN1P04843 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPN1P04843 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPN1P04843 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPN1P04843 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RPN1P04843 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPN1P04843 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPN1P04843 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPN1P04843 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPN1P04843 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPN1P04843 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPN1P04843 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPN1P04843 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms