Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRUB2O95900 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB2O95900 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms