Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX6O95503 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX6O95503 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX6O95503 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX6O95503 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX6O95503 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX6O95503 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX6O95503 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX6O95503 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX6O95503 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX6O95503 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX6O95503 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX6O95503 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX6O95503 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX6O95503 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX6O95503 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX6O95503 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX6O95503 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX6O95503 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX6O95503 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX6O95503 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX6O95503 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX6O95503 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX6O95503 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX6O95503 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX6O95503 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX6O95503 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX6O95503 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX6O95503 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX6O95503 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX6O95503 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX6O95503 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX6O95503 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX6O95503 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX6O95503 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX6O95503 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX6O95503 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX6O95503 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX6O95503 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX6O95503 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX6O95503 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX6O95503 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX6O95503 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX6O95503 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX6O95503 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX6O95503 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX6O95503 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX6O95503 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX6O95503 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX6O95503 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX6O95503 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX6O95503 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX6O95503 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX6O95503 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX6O95503 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX6O95503 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX6O95503 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX6O95503 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX6O95503 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX6O95503 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX6O95503 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX6O95503 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX6O95503 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX6O95503 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX6O95503 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX6O95503 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX6O95503 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX6O95503 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX6O95503 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX6O95503 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX6O95503 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX6O95503 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX6O95503 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX6O95503 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX6O95503 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX6O95503 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX6O95503 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms