Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ9O75208 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ9O75208 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ9O75208 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ9O75208 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ9O75208 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ9O75208 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ9O75208 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ9O75208 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ9O75208 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ9O75208 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ9O75208 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ9O75208 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ9O75208 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ9O75208 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COQ9O75208 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COQ9O75208 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ9O75208 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ9O75208 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ9O75208 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ9O75208 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ9O75208 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ9O75208 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ9O75208 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ9O75208 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ9O75208 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ9O75208 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ9O75208 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ9O75208 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ9O75208 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ9O75208 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ9O75208 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ9O75208 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ9O75208 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ9O75208 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ9O75208 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ9O75208 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COQ9O75208 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ9O75208 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ9O75208 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ9O75208 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ9O75208 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ9O75208 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ9O75208 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ9O75208 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ9O75208 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ9O75208 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COQ9O75208 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COQ9O75208 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COQ9O75208 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COQ9O75208 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COQ9O75208 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms