Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRNO43815 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRNO43815 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRNO43815 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRNO43815 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRNO43815 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRNO43815 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRNO43815 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRNO43815 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRNO43815 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRNO43815 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
STRNO43815 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRNO43815 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRNO43815 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRNO43815 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRNO43815 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STRNO43815 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRNO43815 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRNO43815 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRNO43815 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
STRNO43815 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRNO43815 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRNO43815 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRNO43815 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRNO43815 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRNO43815 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRNO43815 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRNO43815 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRNO43815 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRNO43815 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRNO43815 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRNO43815 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRNO43815 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRNO43815 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRNO43815 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRNO43815 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRNO43815 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRNO43815 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRNO43815 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRNO43815 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STRNO43815 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRNO43815 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRNO43815 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRNO43815 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRNO43815 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRNO43815 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRNO43815 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRNO43815 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRNO43815 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRNO43815 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRNO43815 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRNO43815 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRNO43815 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRNO43815 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRNO43815 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRNO43815 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRNO43815 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRNO43815 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRNO43815 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRNO43815 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRNO43815 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRNO43815 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRNO43815 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRNO43815 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRNO43815 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRNO43815 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
STRNO43815 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRNO43815 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRNO43815 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRNO43815 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRNO43815 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRNO43815 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRNO43815 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRNO43815 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRNO43815 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRNO43815 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRNO43815 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRNO43815 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRNO43815 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRNO43815 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRNO43815 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRNO43815 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRNO43815 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRNO43815 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRNO43815 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRNO43815 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STRNO43815 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STRNO43815 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRNO43815 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRNO43815 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms