Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD6O43541 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD6O43541 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms