Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRTM2O43300 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRTM2O43300 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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