Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LH3BP13 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms