Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGB1P1B2RPK0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB1P1B2RPK0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms