Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf92A6NGG3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf92A6NGG3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms