Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABD2BA6NFA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRABD2BA6NFA1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms