Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSBQ8NFR3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTSSBQ8NFR3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTSSBQ8NFR3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSBQ8NFR3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSBQ8NFR3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSBQ8NFR3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSBQ8NFR3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSBQ8NFR3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSBQ8NFR3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTSSBQ8NFR3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSBQ8NFR3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTSSBQ8NFR3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSBQ8NFR3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSBQ8NFR3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTSSBQ8NFR3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSBQ8NFR3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSBQ8NFR3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSBQ8NFR3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSBQ8NFR3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSBQ8NFR3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSBQ8NFR3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSBQ8NFR3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSBQ8NFR3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSBQ8NFR3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTSSBQ8NFR3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSBQ8NFR3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSBQ8NFR3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSBQ8NFR3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSBQ8NFR3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSBQ8NFR3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSBQ8NFR3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTSSBQ8NFR3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSBQ8NFR3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSBQ8NFR3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSBQ8NFR3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSBQ8NFR3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSBQ8NFR3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSBQ8NFR3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSBQ8NFR3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSBQ8NFR3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTSSBQ8NFR3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSBQ8NFR3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms