Protein–RNA interactions for Protein: O00425

IGF2BP3, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP3O00425 FOXK2-212ENST00000624186 4244 nt13.18□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 35.6
IGF2BP3O00425 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.167e-43■■■■■ 35.3
IGF2BP3O00425 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.625e-7■■■■■ 35.1
IGF2BP3O00425 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.695e-7■■■■■ 35.1
IGF2BP3O00425 SELENOP-201ENST00000505309 573 ntTSL 214.15□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 34.6
IGF2BP3O00425 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.131e-11■■■■■ 34.6
IGF2BP3O00425 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-11■■■■■ 34.6
IGF2BP3O00425 PABPC1-213ENST00000519848 676 ntTSL 210.92□□□□□ -0.661e-9■■■■■ 34.4
IGF2BP3O00425 SERPINA5-203ENST00000553780 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 34.3
IGF2BP3O00425 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 26.64□□□□□ -1.352e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-213ENST00000528839 702 ntTSL 56□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-229ENST00000534272 591 ntTSL 36□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-230ENST00000534470 520 ntTSL 25.45□□□□□ -1.542e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-222ENST00000532120 223 ntTSL 34.05□□□□□ -1.762e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.238e-10■■■■■ 33.8
IGF2BP3O00425 SERPINA1-211ENST00000553327 581 ntTSL 314.77□□□□□ -0.051e-68■■■■■ 33.6
IGF2BP3O00425 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 33.6
IGF2BP3O00425 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 33.6
IGF2BP3O00425 GNG5-203ENST00000487806 557 ntTSL 37.76□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 33.6
IGF2BP3O00425 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-11■■■■■ 33.2
IGF2BP3O00425 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-11■■■■■ 33.2
IGF2BP3O00425 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.71e-11■■■■■ 33.2
IGF2BP3O00425 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 PABPC1-209ENST00000519100 851 ntTSL 35.37□□□□□ -1.557e-11■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 SELENOP-211ENST00000513303 714 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 32.4
IGF2BP3O00425 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 28.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 32.4
IGF2BP3O00425 TPT1-209ENST00000528619 731 ntTSL 28.91□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 TPT1-211ENST00000530245 530 ntTSL 36.28□□□□□ -1.46e-8■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 HECTD1-214ENST00000556281 684 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.227e-8■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 328.78■■■□□ 2.25e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 227.94■■■□□ 2.065e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 527.65■■■□□ 2.025e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.95e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 322.85■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 219.87■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 31.9
IGF2BP3O00425 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-10■■■■■ 31.9
IGF2BP3O00425 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 NFAT5-204ENST00000426654 14219 ntTSL 1 (best)8.07□□□□□ -1.123e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 CPD-209ENST00000584221 680 ntTSL 36.56□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.267e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.17e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.227e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 HECTD1-208ENST00000554882 3748 ntTSL 55.98□□□□□ -1.457e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 HECTD1-210ENST00000555843 4281 ntTSL 24.92□□□□□ -1.627e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-10■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 SLC35F5-202ENST00000409106 3120 ntTSL 217.93■□□□□ 0.463e-10■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 SLC35F5-209ENST00000469702 784 ntTSL 39.88□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 SLC35F5-204ENST00000420066 736 ntTSL 35.9□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.623e-9■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.316e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 323.04■■□□□ 1.286e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 223.04■■□□□ 1.286e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 521.16■□□□□ 0.986e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 321.03■□□□□ 0.966e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 320.7■□□□□ 0.96e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.166e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 213.94□□□□□ -0.186e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 513.94□□□□□ -0.186e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.266e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 513.34□□□□□ -0.276e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.526e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.536e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.936e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 58.08□□□□□ -1.126e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.126e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.88□□□□□ -1.316e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 GPATCH8-211ENST00000635257 5602 ntTSL 511.99□□□□□ -0.495e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.665e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 GPATCH8-205ENST00000587228 4713 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.835e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 GPATCH8-201ENST00000335500 8109 ntTSL 29.22□□□□□ -0.935e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-205ENST00000465744 710 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.027e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-204ENST00000465340 2240 ntTSL 213.74□□□□□ -0.217e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.377e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-HNRNPH2-202ENST00000409338 572 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.617e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 30.5
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