RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.2■■■■■ 4.19
NME4-210ENST00000468031 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.65■■■■□ 3.3
NME4-210ENST00000468031 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
NME4-210ENST00000468031 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.1■■■■□ 3.05
NME4-210ENST00000468031 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.97■■■■□ 3.03
NME4-210ENST00000468031 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.73■■■□□ 2.99
NME4-210ENST00000468031 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.47■■■□□ 2.95
NME4-210ENST00000468031 ABCC9O60706 1549 aa33.13■■■□□ 2.89
NME4-210ENST00000468031 NACADO15069 1562 aa33.06■■■□□ 2.88
NME4-210ENST00000468031 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
NME4-210ENST00000468031 SCRIBQ14160 1630 aa32.84■■■□□ 2.85
NME4-210ENST00000468031 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.62■■■□□ 2.81
NME4-210ENST00000468031 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
NME4-210ENST00000468031 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32■■■□□ 2.71
NME4-210ENST00000468031 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.94■■■□□ 2.7
NME4-210ENST00000468031 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.93■■■□□ 2.7
NME4-210ENST00000468031 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.84■■■□□ 2.69
NME4-210ENST00000468031 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
NME4-210ENST00000468031 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.64■■■□□ 2.66
NME4-210ENST00000468031 WIZO95785 1651 aa31.61■■■□□ 2.65
NME4-210ENST00000468031 SMARCA4P51532 1647 aa31.54■■■□□ 2.64
NME4-210ENST00000468031 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.611e-8■■□□□ 14.2
NME4-210ENST00000468031 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
NME4-210ENST00000468031 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.17■■■□□ 2.58
NME4-210ENST00000468031 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
NME4-210ENST00000468031 SMARCA2P51531 1590 aa31.04■■■□□ 2.56
NME4-210ENST00000468031 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.99■■■□□ 2.55
NME4-210ENST00000468031 TRIM41Q8WV44 630 aa30.99■■■□□ 2.55
NME4-210ENST00000468031 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.87■■■□□ 2.53
NME4-210ENST00000468031 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
NME4-210ENST00000468031 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.7■■■□□ 2.5
NME4-210ENST00000468031 HMGXB3Q12766 1538 aa30.54■■■□□ 2.48
NME4-210ENST00000468031 ABCC8Q09428 1581 aa30.53■■■□□ 2.48
NME4-210ENST00000468031 NCAPD3P42695 1498 aa30.51■■■□□ 2.48
NME4-210ENST00000468031 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
NME4-210ENST00000468031 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
NME4-210ENST00000468031 EEA1Q15075 1411 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-210ENST00000468031 SYNJ1O43426 1573 aa30.13■■■□□ 2.41
NME4-210ENST00000468031 SOGA1O94964 1423 aa30.08■■■□□ 2.41
NME4-210ENST00000468031 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.01■■■□□ 2.39
NME4-210ENST00000468031 CFTRP13569 1480 aa30■■■□□ 2.39
NME4-210ENST00000468031 TOP2BQ02880 1626 aa29.97■■■□□ 2.39
NME4-210ENST00000468031 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.94■■■□□ 2.38
NME4-210ENST00000468031 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.93■■■□□ 2.38
NME4-210ENST00000468031 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.93■■■□□ 2.38
NME4-210ENST00000468031 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.92■■■□□ 2.38
NME4-210ENST00000468031 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.91■■■□□ 2.38
NME4-210ENST00000468031 PRDM2Q13029 1718 aa29.9■■■□□ 2.38
NME4-210ENST00000468031 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
NME4-210ENST00000468031 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.81■■■□□ 2.36
NME4-210ENST00000468031 GOLGA3Q08378 1498 aa29.78■■■□□ 2.36
NME4-210ENST00000468031 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.76■■■□□ 2.35
NME4-210ENST00000468031 KIF21BO75037 1637 aa29.76■■■□□ 2.35
NME4-210ENST00000468031 CUX1P39880 1505 aa29.73■■■□□ 2.35
NME4-210ENST00000468031 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.72■■■□□ 2.35
NME4-210ENST00000468031 CEP162Q5TB80 1403 aa29.68■■■□□ 2.34
NME4-210ENST00000468031 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.66■■■□□ 2.34
NME4-210ENST00000468031 HRCP23327 699 aa29.6■■■□□ 2.33
NME4-210ENST00000468031 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
NME4-210ENST00000468031 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.46■■■□□ 2.31
NME4-210ENST00000468031 KIF27Q86VH2 1401 aa29.46■■■□□ 2.31
NME4-210ENST00000468031 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.45■■■□□ 2.31
NME4-210ENST00000468031 PRXQ9BXM0 1461 aa29.43■■■□□ 2.3
NME4-210ENST00000468031 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.43■■■□□ 2.3
NME4-210ENST00000468031 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.37■■■□□ 2.29
NME4-210ENST00000468031 CLIP1P30622 1438 aa29.31■■■□□ 2.28
NME4-210ENST00000468031 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.31■■■□□ 2.28
NME4-210ENST00000468031 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.29■■■□□ 2.28
NME4-210ENST00000468031 NESP48681 1621 aa29.28■■■□□ 2.28
NME4-210ENST00000468031 CUX2O14529 1486 aa29.23■■■□□ 2.27
NME4-210ENST00000468031 TOPBP1Q92547 1522 aa29.19■■■□□ 2.26
NME4-210ENST00000468031 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
NME4-210ENST00000468031 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.16■■■□□ 2.26
NME4-210ENST00000468031 IGF1RP08069 1367 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-210ENST00000468031 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.11■■■□□ 2.25
NME4-210ENST00000468031 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
NME4-210ENST00000468031 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-210ENST00000468031 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
NME4-210ENST00000468031 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-210ENST00000468031 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-210ENST00000468031 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NME4-210ENST00000468031 ARAP1Q96P48 1450 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-210ENST00000468031 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.95■■■□□ 2.22
NME4-210ENST00000468031 WDR97A6NE52 1622 aa28.94■■■□□ 2.22
NME4-210ENST00000468031 CUL7Q14999 1698 aa28.87■■■□□ 2.21
NME4-210ENST00000468031 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
NME4-210ENST00000468031 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.84■■■□□ 2.21
NME4-210ENST00000468031 APLP2Q06481 763 aa28.83■■■□□ 2.21
NME4-210ENST00000468031 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
NME4-210ENST00000468031 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.8■■■□□ 2.2
NME4-210ENST00000468031 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
NME4-210ENST00000468031 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.71■■■□□ 2.19
NME4-210ENST00000468031 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.69■■■□□ 2.18
NME4-210ENST00000468031 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.63■■■□□ 2.17
NME4-210ENST00000468031 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
NME4-210ENST00000468031 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.6■■■□□ 2.17
NME4-210ENST00000468031 MAP3K1Q13233 1512 aa28.57■■■□□ 2.16
NME4-210ENST00000468031 WDR62O43379 1518 aa28.55■■■□□ 2.16
NME4-210ENST00000468031 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.53■■■□□ 2.16
NME4-210ENST00000468031 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 211.1 ms