Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 LINC00969-259ENST00000625776 911 ntTSL 55.98□□□□□ -1.459e-14■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 LINC00969-308ENST00000628547 882 ntTSL 55.7□□□□□ -1.59e-14■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 LINC00969-251ENST00000618708 606 ntTSL 54.6□□□□□ -1.679e-14■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.359e-14■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 TGFBR3-211ENST00000533370 563 ntTSL 412.67□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 AKR1B1-208ENST00000484592 639 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-7■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 AKR1B1-212ENST00000497983 534 ntTSL 414.61□□□□□ -0.071e-7■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 AKR1B1-207ENST00000467829 561 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 AKR1B1-202ENST00000426422 521 ntTSL 410.19□□□□□ -0.781e-7■■■■□ 25.3
DGCR8Q8WYQ5 POU2F1-201ENST00000271411 13945 ntTSL 1 (best)7.47□□□□□ -1.215e-7■■■■□ 25.1
DGCR8Q8WYQ5 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.535e-7■■■■□ 25.1
DGCR8Q8WYQ5 POU2F1-203ENST00000367865 14332 ntTSL 25.33□□□□□ -1.565e-7■■■■□ 25.1
DGCR8Q8WYQ5 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.615e-7■■■■□ 25.1
DGCR8Q8WYQ5 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.665e-7■■■■□ 25.1
DGCR8Q8WYQ5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 25
DGCR8Q8WYQ5 LRCH1-204ENST00000443945 2070 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 25
DGCR8Q8WYQ5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 25
DGCR8Q8WYQ5 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 25
DGCR8Q8WYQ5 CCPG1-201ENST00000310958 6822 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.615e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.995e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 CCPG1-213ENST00000570272 570 ntTSL 47.34□□□□□ -1.235e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 CCPG1-208ENST00000568372 3388 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.425e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.535e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 CCPG1-211ENST00000568808 2866 ntTSL 1 (best)5.06□□□□□ -1.65e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 CCPG1-204ENST00000563171 790 ntTSL 54.52□□□□□ -1.695e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.785e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.085e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.375e-9■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 FOS-207ENST00000555672 834 ntTSL 213.14□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.032e-7■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.032e-7■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.952e-7■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-7■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 24.9
DGCR8Q8WYQ5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 24.8
DGCR8Q8WYQ5 SLC16A3-218ENST00000583444 2882 nt20.67■□□□□ 0.92e-7■■■■□ 24.7
DGCR8Q8WYQ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.284e-6■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 RBM39-204ENST00000374038 1026 ntTSL 515.35■□□□□ 0.053e-11■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 RBM39-207ENST00000412738 1018 ntTSL 312.61□□□□□ -0.393e-11■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 RBM39-214ENST00000434927 716 ntTSL 58.27□□□□□ -1.093e-11■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 RBM39-232ENST00000481037 687 ntTSL 33.72□□□□□ -1.813e-11■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 RBM39-210ENST00000425184 526 ntTSL 32.7□□□□□ -1.983e-11■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 TRIM41-208ENST00000515499 914 ntTSL 320.33■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 TRIM41-204ENST00000508930 3834 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 24.6
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-206ENST00000564709 2316 ntTSL 224.14■■□□□ 1.451e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.431e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-209ENST00000567868 1628 ntTSL 322.63■■□□□ 1.211e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-211ENST00000569380 1781 ntTSL 220.57■□□□□ 0.881e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-204ENST00000563741 1746 ntTSL 519.73■□□□□ 0.751e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-203ENST00000563705 876 ntTSL 519.48■□□□□ 0.711e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-207ENST00000565550 898 ntTSL 217.76■□□□□ 0.431e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-202ENST00000563668 1509 ntTSL 217.49■□□□□ 0.391e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.351e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-205ENST00000564070 714 ntTSL 315.21■□□□□ 0.031e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 SPSB3-212ENST00000569769 580 ntTSL 311.94□□□□□ -0.51e-10■■■■□ 24.5
DGCR8Q8WYQ5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 C11orf95-203ENST00000445014 827 ntTSL 525.16■■□□□ 1.625e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.415e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 PEX10-205ENST00000508384 611 ntTSL 321.69■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)21.5■■□□□ 1.035e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 HGFAC-203ENST00000509689 1894 ntTSL 521.15■□□□□ 0.985e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 C11orf95-201ENST00000338498 723 ntTSL 1 (best)20.39■□□□□ 0.855e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.765e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.745e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.272e-10■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 TBC1D9B-216ENST00000522224 532 ntTSL 516.71■□□□□ 0.272e-10■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 RCC1-205ENST00000411533 1169 ntTSL 514.06□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 RCC1-210ENST00000434290 1070 ntTSL 513.41□□□□□ -0.265e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 RCC1-206ENST00000419074 997 ntTSL 513.36□□□□□ -0.275e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 212.69□□□□□ -0.387e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.465e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 511.98□□□□□ -0.495e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.685e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 226.66■■□□□ 1.863e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME3-203ENST00000563367 891 ntTSL 326.55■■□□□ 1.843e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME3-208ENST00000565379 911 ntTSL 225.67■■□□□ 1.73e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME3-209ENST00000566600 913 ntTSL 225.34■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 524.64■■□□□ 1.533e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME3-202ENST00000561637 1014 ntTSL 222.97■■□□□ 1.273e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 321.29■■□□□ 13e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 220.79■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.578e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME3-207ENST00000564628 811 ntTSL 518.21■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 317.5■□□□□ 0.393e-7■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 316.98■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 216.89■□□□□ 0.296e-8■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 316.31■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 24.4
DGCR8Q8WYQ5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 24.4
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