Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
V9GYH0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
V9GYH0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
V9GYH0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
V9GYH0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
V9GYH0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
V9GYH0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
V9GYH0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
V9GYH0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
V9GYH0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
V9GYH0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
V9GYH0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
V9GYH0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
V9GYH0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
V9GYH0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
V9GYH0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
V9GYH0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
V9GYH0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
V9GYH0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
V9GYH0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
V9GYH0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
V9GYH0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
V9GYH0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
V9GYH0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
V9GYH0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
V9GYH0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
V9GYH0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
V9GYH0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
V9GYH0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
V9GYH0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
V9GYH0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
V9GYH0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
V9GYH0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
V9GYH0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
V9GYH0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
V9GYH0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
V9GYH0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
V9GYH0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
V9GYH0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
V9GYH0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
V9GYH0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
V9GYH0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
V9GYH0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
V9GYH0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
V9GYH0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms