Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIAS3Q9Y6X2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIAS3Q9Y6X2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms