Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E6

PCDHB3, Protocadherin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB3Q9Y5E6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB3Q9Y5E6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB3Q9Y5E6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB3Q9Y5E6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB3Q9Y5E6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB3Q9Y5E6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB3Q9Y5E6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB3Q9Y5E6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB3Q9Y5E6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms