Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXBP1Q9Y5B6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXBP1Q9Y5B6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms