Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCF1Q9Y324 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FCF1Q9Y324 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FCF1Q9Y324 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FCF1Q9Y324 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms