Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC2Q9Y235 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms