Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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