Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SS18L2Q9UHA2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SS18L2Q9UHA2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms