Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
KDM5BQ9UGL1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
KDM5BQ9UGL1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
KDM5BQ9UGL1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms