Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT172Q9UG01 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT172Q9UG01 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.81■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IFT172Q9UG01 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms