Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLKQ9UBT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
POLKQ9UBT6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLKQ9UBT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms