Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PRO2289Q9P1D8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PRO2289Q9P1D8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms