Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COMMD8Q9NX08 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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