Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL17Q9NRX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL17Q9NRX2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms