Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CD163L1Q9NR16 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CD163L1Q9NR16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CD163L1Q9NR16 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
CD163L1Q9NR16 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CD163L1Q9NR16 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CD163L1Q9NR16 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CD163L1Q9NR16 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms