Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSCN3Q9NQT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSCN3Q9NQT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms