Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL25A1Q9BXS0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms